连云港白塔埠机场始建于1956年，1985年3月26日开通民用航线，1989年12月8日完成一期扩建工程，1993年12月29日完成二期改扩建工程。
据2019年11月连云港白塔埠机场官网显示，连云港白塔埠机场拥有两座候机楼（航站楼），分别为T1（中国国内）、T2（国际及港澳台）共1.2万平方米，共一条跑道和一条联络道，跑道长度为2500米，宽50米，联络道长度为2500米，宽23米；停机位8个；截至2019年10月，共通航中国国内外城市35个，每周航班量达到210个班次。
2018年，连云港白塔埠机场旅客吞吐量1516195人次，同比增长38.7%；货邮吞吐量2906.4吨，同比增长74.8%；起降14978架次，同比增长33.4%；分别位居中国第76、第82、第104位。

民国18年（1929年）中国航空公司成立，京平航线为中美航空邮运合同中规定由“中航”经营的第二条航线，此航线由南京起飞，经徐州、济南、天津至北平，于民国20年4月开始试飞后，因航线与津浦铁路线平行，客货营业都比较清淡，亏蚀颇多，当年12月即告停航。
民国19年（1930年）6月，中国航空公司将京平航线改为上海——天津航线。此线由上海起飞后，大部分航程为沿海飞行，中途经停海州（今连云港市）、青岛至天津。后来又决定在南段由上海起飞后，绕道南京再到海州，北段则由天津延伸到北平，改称沪平航线。
民国21年（1932年），上海至北平的沪平线路过海州，中国航空公司兴建海州机场（杨圩机场）。机场位于东海县，东经119°9′，北纬34°36′ 。机场北面长1097米，西面长1036米，南面长488米，东面长671米。机场有200瓦短波通讯无线机1套，风标、寒暑表、气压表各1只。
民国22年（1933年）1月11日，沪平航线正式开航。“欧亚”南京至北平沿海线经停海州站，其飞行班次为：每星期上海和北平对飞各3次。
1955年，因国防需要，南京军区空军在连云港白塔埠镇征集土地，建二级永备机场。
1956年，空军连云港机场动工兴建，主跑道长2200米、宽60米、厚0.16米，滑行道长2250米、宽16米、厚0.16米，均采用水泥混凝土材料；集体停机坪2条，各长350米、宽35米；加油坪1条，长400米、宽32米，均为水泥混凝土材料；土跑道1条，长2200米、宽200米；土保险道2条，各长400米、宽311米。全部工程于1957年建成。
1959年11月，新海连市经过三处考察选定锦屏山东南西为民航新海连站场址（现海州区锦屏镇南约三公里的大普安（李圩））。其优点为：距市区较近，靠矿区公路6公里，距市中心约20公里；地势较高，比市区高出0.6米；大部分是荒地，无民房村落之迁拆；为灭蝗中心，地区适中；所需砂石材料，可就地取材，较为经济。
1960年12月，民航新海连站开始建设。机场飞行带面积长为600米、宽200米，跑道长400米、宽25米，碎石铺面结构；两端安全带各200×100米，两侧安全带各400×50米，均为土质结构。机场坐标为东经119°09′，北纬34°29′。建筑所需材料、工程机械费、运输费等21.92万元，电力、通讯、场内公路、房屋建筑等12.45万元。机场起降安—2型飞机，系民用机场。
1961年，民航新海连站更名为民航连云港站，南京—新海连航线试飞成功，机场试航后未正式开航。
1962年，民航连云港站根据民航总局统一部署撤销。
1984年，国务院确定连云港市为全国首批十四个沿海开放城市之一。连云港市委、市政府在制定对外开放和经济发展规划时，果断地将发展连云港民航运输事业、改善投资环境摆上了重要议事日程。
1984年4月3日，连云港市人民政府提出重建民航连云港站的请求。
1984年4月25日，江苏省人民政府向国务院、中央军委呈送《关于要求在连云港市开辟民用航线的请示》。
1984年7月3日，国务院、中央军委以“国发[1984]90号”《关于同意民航使用空军连云港机场的批复》，同意民航使用空军白塔埠机场。
1985年1月12日，为便于机场管理和保证飞行安全，民用设施建设与军队分开，自成系统。民航江苏省局与市政府签定《关于建立中国民用航空连云港站协议书》，组建了民航连云港站工程建设办公室，在市政府统一领导下，全面负责民航连云港站工程的建设工作；确定机场占地10公顷，其中占用东海县白塔埠镇西柳村土地8公顷，这部分土地主要用于航站区停机坪、候机室、航管楼、办公室、仓库、武警营房以及辅助用房。
1985年3月16日，机场举行试航仪式，上海至连云港航线试飞成功。
1985年3月26日，经过6个月的筹建，机场完成简易候机室和其他简易通航设施工程，在候机楼、停机坪未建成，设施、设备尚不完善的情况下，民航连云港站正式简易开航。
1986年11年26日，经民航总局批准“（86）民航局函字第727号《关于连云港民航站建站工程计划书的批复》”，投资1856万元对民航机场进行修建，其中民航投资600万元，主要用于民航通信导航、特种车辆设备购置。江苏省政府投资200万元，连云港市政府投资1056万元。
1987年5月1日，标志着建站工程的主体建筑候机室、航管楼正式破土动工。
1987年9月，连云港民航站建站工程在民航总局的主持下通过了初步设计审查。规模按高峰200人次/小时的旅客流量设计，候机楼建筑面积3480平方米，航管楼建筑面积1370平方米，停机坪面积102米×60.5米，可停放两架BAe-146型飞机，联络道面积为181.3米×18米，两边各有4.5米的道肩，停机坪和联络道原设计厚度为20厘米。
1987年11月，经民航总局批准，机场油库按1500立方米建造，建设北远、近导航台，中心发射台，机房面积共计800平方米，场内生产辅助用房、行政办公、生活设施总建筑面积5290平方米，场道工程基础（停机坪和联络道）按BAe 146型飞机的标准设计并修建，跑道用原空军飞行跑道，规模为2200米×60米。
1988年5月，民航连云港站动工新建候机楼、航管楼、配电房、停机坪、锅炉房、浴室等，投资1883.79万元人民币。
1989年5月，民航连云港站基本竣工。同年12月8日，通过验收。
1990年7月11日，连云港市政府向省政府上报“连政发[1990]123号”《关于报送<连云港机场扩建二期工程项目建议书>的请示》。
1990年10月7日，省政府向国家计委、总参上报了《关于转报连云港机场扩建二期工程项目建议书的请示》。
1992年5月18日，连云港市政府向民航总局上报了连政发[1992]72号《关于呈报连云港机场扩建二期工程预可行性报告的请示》。
1992年7月21日，民航总局向国家计委发函，民航局函[1992]901号《关于对连云港机场扩建工程预可行性报告的意见的函》，同意连云港机场进行第二期扩建工程。
1992年9月17日，总参国家纪委联合向江苏省政府和空军、民用航空局行文[1992]参作字第8433号《关于扩建连云港机场的批复》，同意按MD-82和B767型飞机的使用要求，扩建空军连云港机场，工程所需资金全部由地方政府筹措，因扩建需牵动的军事设施，由地方政府负责建设。
1993年3月31日，连云港机场扩建二期工程开工。工程投资7000万元，其中国家投资3000万元、地方政府投资4000万元。1993年12月29日，工程通过竣工验收。
1994年1月1日，连云港机场二期扩建工程正式交付使用。机场二期工程扩建后，飞行区达到国家4D级标准。飞行区地势平坦，净空良好，拥有2500米长，50米宽的跑道和2500米长、23米宽的联络道各一条，停机坪2.04万平方米。机场安装有先进的仪表着陆系统和全向信标仪，有先进的助航灯光系统，航管二次雷达和气象雷达，可起降波音767、麦道82等大型运输机，从此结束了连云港机场不能起降大型飞机的历史。候机楼3500平方米，候机室客流量为300人/小时；楼内设有办理乘机手续和为旅客提供餐饮、购物、休息、通信的服务设施。
2000年3月27日，民航连云港站巡场围界工程经连云港市建设工程质量监督站检验，通过竣工验收。
2003年6月28日，民航连云港站新候机楼改扩建工程开工，该工程总投资2000多万元人民币，建筑面积5100平方米，包括候机厅、迎接厅、出港厅和附属用房。
2003年11月26日，国家民航总局、江苏省人民政府在南京举行民航机场交接仪式，民航江苏省局所属的连云港白塔埠、常州奔牛、南通兴东机场移交给省政府。根据省政府第17次常务会议通过的《江苏民航管理体制、行政管理体制和机场公安机构改革方案》，民航站直接下放到所在市管理。
2004年6月22日，民航新候机楼工程通过了民航华东地区管理局、市有关部门的验收。
2006年7月24日，连云港市领导就筹建连云港机场国际联检厅到机场专题调研。
2007年6月8日，连云港至南京（香港）联程航线正式开通。这是连云港市史上开通的首条国际（地区）联程航线。
2008年9月8日，国家发改委率19个部委领导来连云港调研江苏沿海开发战略，连云港市正式提出新机场规划选址工作。
2008年10月31日，《连云港机场总体规划》通过民航华东地区管理局评审。根据规划，连云港民航机场的发展定位为区域性国际机场。
2009年3月27日，新建连云港航管业务楼全面竣工，顺利通过校飞，正式投入使用。
2009年3月31日，连云港市发改委在市行政中心1716会议室主持召开了连云港机场候机厅改扩建工程可行性研究报告评审会。连云港机场国际厅改扩建项目可研报告通过专家评审。
2009年4月2日，连云港市发改委在市行政中心1716会议室主持召开了连云港机场国际候机厅改扩建工程初步设计报告评审会。连云港机场国际厅改扩建项目初步设计通过专家评审。
2009年8月16日，连云港机场国际厅改扩建项目举行奠基仪式，正式破土动工。
2010年8月，国家口岸办在收到公安部、海关总署、质检总局、民航总局、中央军委空军等部门同意我市空港临时开放的意见后，以国岸函[2010]67号向江苏省口岸办下发了《关于同意连云港至韩国首尔临时客运航班在连云港机场出入境的批复》，可每周执行4班至韩国首尔的航班。
2010年10月8日，连云港市人们政府与连云港市检验检疫局签署了关于连云港航空口岸临时开放保障事宜备忘录。
2010年11月15日，连云港机场联检综合楼工程竣工并投入使用。
2010年12月3日，连云港机场国际候机厅工程竣工。
2010年12月11日，连云港机场国际候机厅工程通过民航专业行业验收。
2010年12月15日，连云港机场航空口岸临时开放，开通至韩国首尔航班，成为连云港开辟的第一条国际航班。
2011年6月，连云港机场对外开放被列入《国家口岸“十二五”发展规划(2011-2015)》，并于2013年列入国家年度口岸开放审理计划。
2011年7月18日，连云港白塔埠机场公司正式正式揭牌。
2011年9月7日，连云港机场顺利通过民航华东地区管理局的航空保安后续审计。
2012年10月8日，国家口岸办正式批准连云港市开通连云港至香港出入境临时客运包机航线。
2012年10月29日，连云港机场举行连云港至香港航班包机航线首航仪式。连云港成为继南京、无锡、徐州、盐城之后，江苏省内第五个开通香港航线的城市。
2013年5月，江苏省人民政府将连云港机场对外开放的请示重新上报国务院。
2014年6月29日，由中国东方航空开通的连云港至香港航线恢复运行。航线恢复后由每周两班改为每周一班。
2014年7月1日，国家民航总局正式批复同意连云港新机场选址方案。
2015年7月30日，经海关总署委托国家口岸办征求国家质检总局、公安部、民航总局、总参作战部、中编办和总署人教司的意见同意后，经海关总署与发改委、总参会签后，海关总署将《关于江苏省连云港白塔埠机场对外开放的请示》(署岸发字[2015]38号)上报国务院。
2015年9月17日，国务院以国函[2015]144号下发了《国务院关于同意江苏连云港白塔埠机场对外开放的批复》。
2016年12月23日，海关总署发布《国家口岸发展“十三五”规划》，连云港港口口岸、连云港航空口岸作为扩大开放口岸列入“十三五”全国口岸开放项目表。
2017年1月16日，连云港白塔埠机场空港口岸开放通过了省级预验收。
2017年2月9日，连云港白塔埠机场航空口岸对外开放顺利通过由国家质检总局组织的国家级检查预审。
2017年5月18日，由海关总署（国家口岸管理办公室）会同公安部等单位组成验收组召开连云港白塔埠机场航空口岸对外开放国家验收会议，验收组一致同意连云港白塔埠机场航空口岸对外开放通过国家验收。
2017年12月6日，连云港白塔埠机场旅客吞吐量突破100万人次，标志着连云港机场正式迈入全国中型机场行列。
2017年12月29日，连云港机场开通直飞泰国曼谷的航班，成为连云港机场航空口岸正式开放后开通的第一条国际航线。
2018年4月18日，连云港白塔埠机场国内候机厅扩容改造项目批前公示。建筑内容为扩建候机厅一栋（一层）呈“L”形，建筑层高5.5米，建筑高度5.8米，与国内航站楼贴建。扩建候机厅建筑面积为978平方米，新建安检雨棚面积75平方米，新增车位110个。
2018年10月，连云港至大阪往返客运航线过中国民用航空局审批。连云港至大阪往返客运航线，使用机型为B737-800，每周7班。
2019年1月4日，连云港军民合用机场民用部分迁建工程可行性研究报告获得国家发改委正式批复（发改基础〔2019〕21号）。
2019年1月23日，西安至连云港至静冈客货航线通过中国民用航空局审批。
2019年2月12日，连云港新机场项目正式开工建设，民航机场进行迁建完成后连云港机场将实现军民航的分开设置，白塔埠机场将保留现状，逐步转为军用机场。
2019年3月12日，连云港至济州客货航线通过中国民用航空局审批。
2019年9月8日，“连云港号”西游文化航空宣传首航活动在北京、连云港两地举办。上午11点10分，“连云港号”飞机抵达连云港白塔埠机场，在滑行区穿越“水门”滑行而过。此次活动由连云港市文化广电和旅游局、中国联合航空公司、连云港白塔埠机场有限责任公司联合举办，以中国红为主色调的“连云港号”飞机是连云港市文化广电和旅游局、中国联合航空公司联合上海美术电影制片厂携手打造的全球首架全机体西游文化主题彩喷客机，是连云港市创新开展文化旅游宣传，展示提升城市形象的重要举措。
2019年9月10日，连云港市人民政府与东部机场集团有限公司举行推动民航高质发展战略合作协议签约仪式。双方签署《推动民航高质发展战略合作协议》，东部机场集团有限公司同时与连云港市国资委签署《连云港花果山机场建设投资有限公司增资协议》《连云港白塔埠机场股权转让协议》，标志着连云港机场正式加入东部机场集团有限公司。
2019年11月10日，连云港机场开通直飞日本静冈的航班，成为继泰国曼谷航线后开通的第二条国际航线。
2019年11月25日，连云港机场开通直飞日本大阪的航班，成为继日本静冈航线后开通的第二条前往日本的国际航线。
2020年1月1日，连云港机场开通“天津-连云港-深圳”定期货运航班，成为连云港机场开通的第一条全货机航线。